RESUMEN:
La infección por VPH es un factor necesario, mas no suficiente, para la aparición de lesiones cervicales neoplásicas que pueden progresar a cáncer cervicouterino. Entre los más de 200 genotipos de VPH caracterizados a la fecha, un grupo de 14 se consideran de alto riesgo para la progresión de las lesiones neoplásicas cervicales a cáncer; entre ellos se encuentra VPH 51, un genotipo con una prevalencia mundial estimada entre 0.5 y 4%. Debido a antecedentes de una prevalencia inusualmente alta de VPH 51 en pacientes con lesiones neoplásicas en evolución y pacientes con cáncer en la región centro de México, es de interés conocer si existen variantes regionales que pudieran tener un impacto adicional en la persistencia de dichas lesiones o en potenciales programas de vacunación si VPH 51 se incorpora al esquema de vacunación. Para ello, se realizó un estudio ambispectivo sobre 44 pacientes positivas a VPH 51 y que presentaran grados variables de evolución de lesiones cervicales o carcinoma, con el fin de determinar la variabilidad genética de los genes L1 y L2 de VPH 51 y determinar si existen variantes de interés. Mediante amplificación por PCR y secuenciación, se obtuvieron las secuencias de L1 y L2 de las muestras de pacientes, y se realizó el análisis bioinformático para determinar la presencia de polimorfismos, filogenia y traducción in silico para determinar posibles mutaciones, así como la posibilidad de selección presente sobre las mismas mediante análisis de neutralidad de D de Tajima. Se determinó la presencia de varios polimorfismos de interés, tanto únicos como comunes entre diferentes grupos de lesión, de los cuales sólo unos pocos producían alteraciones en la secuencia de aminoácidos traducida in silico de las secuencias consenso para cada grupo. En particular, se encontró en L1 la presencia común de los genotipos V277G y G278S, mientras que en L2 es de especial interés la secuencia variante EPIAP en los aminoácidos 95 a 99, que podría tener potencial inmunogénico para ser utilizado como vacuna. Se determinó que, pese a la presencia de variabilidad natural en las secuencias, no existe evidencia suficiente para afirmar la existencia de variantes regionales de VPH 51 en estos genes, y se recomiendan estudios más numerosos para confirmar o refutar esta evidencia.
ABSTRACT:
HPV infection is a necessary, yet not enough, factor for the appearance of neoplastic cervical lesions that can progress to cervical cancer. Among the over 200 HPV genotypes characterized so far, a group of 14 is considered of high risk for the progression of neoplastic lesions to cancer; there HPV 51 can be found, a genotype with an estimated global prevalence between 0.5 and 4%. Due to a background of an unusually high HPV 51 prevalence in patients with neoplastic lesions currently in evolution and cancer patients in Central Mexico, it is of interest to determine if there exist any regional variants that could generate an additional impact in the persistence of such lesions or in potential vaccination programs if HPV 51 is ever added to vaccination schemes. For that, an ambispective study was performed with 44 HPV 51-positive patients in Central Mexico that presented variable degrees of evolution of neoplastic lesions or carcinoma, with the aim to determine the genetic variability of L1 and L2 genes of HPV 51 and determine if variants of interest exist. Using PCR amplification and sequencing, L1 and L2 genetic sequences were obtained from patient samples, and bioinformatic analysis was carried on determining the presence of polymorphisms, phylogeny and in silico translation to determine potential mutations, as well as the possibility of present selection using Tajima’s D test of neutrality. The presence of several polymorphisms of interest was determined, both unique and shared among lesion groups, of which only a handful produced alterations in the amino acid sequence translated in silico from consensus sequences for each group. In particular, the ubiquitous presence of V277G and G278S polymorphisms in L1 was detected, as well as the variant sequence EPIAP in amino acid positions 95 o 99, the latter of which could have immunogenic potential to be used as a vaccine. It was concluded that, despite the presence of natural variability among the analyzed sequence, there is not enough evidence to confirm the existence of regional variants of HPV 51 in these genes, and more numerous studies are recommended to confirm or refute this evidence.
